长时间久居地下，加上充足
营养与运动，约瑟夫外貌产生
定幅度改变。再加上他第二次进入休眠仓时候要求智能电脑以内部调节方式对自己外观进行修整……他出现在人类世界外表与之前相符程度约为百分之八十。
确定无人怀疑之后，他开始抛出具有分量研究成果——米伽尔药剂。
是，就是佩里亚斯神父研制那种同名药剂。“米伽尔”这个药剂代号实际上是约瑟夫提出，当时并没有佩里亚斯研究成品那
音书》中所说那样，而是个围绕太阳旋转球体。
来自圣主压力是如此沉重，这些事情如果拿到外面公开，约瑟夫肯定会被裁判所以“异端”身份处以火刑。他信仰崩溃，进而萌发出想要离开这个地方迫切心理。
他从智能电脑那里得知些与自己相关秘密——人类寿命其实可以通过对细胞活化处理方式加以改变。正常情况下，健康人类生命极限为百年左右。这是个存在于理论上极限数字，其实大多数人在九十、八十、七十，甚至六十岁就步入死亡。然而培养舱出现使生命延长成为可能。就像改变不良生活习惯，饮食规律，加强运动，直接效果会促使身体全面好转。只要进入培养舱，接受为期年休眠，就可以在电脑帮助下强化细胞活力，达到延长寿限目。
更重要是，在休眠期间，智能电脑根据休眠者自身状况进行生理调节，使休眠者体能、精神、反应能力等综合数值达到最优状态。
在文明时代，这曾经是顶级富豪与权贵专享权利。随着科技不断进化，逐渐进入中上等级人类群体。约瑟夫很幸运，他被智能电脑默认为“残存同族”，于是相关权限下放并得以扩大，除无法接触到核心机密，他已经成为这部分基地空间实际上主人。
他花大量时间研究自己掉下来那条通道，并在智能电脑帮助下制作些简单辅助器械。在休眠苏醒后年多时间里，约瑟夫对这些设备进行安装，找到条自认为成功概率很大逃生之路。确定这点，他再次进入培养舱休眠，开始长达年生物调配期。
第二次苏醒，约瑟夫感觉自己精力十足，浑身上下力量充沛无比，就像重新回到最具活力十八岁。
他离开地下世界，凭着强健体魄和过人技巧，攀上悬崖，重返人世。
在地下遗迹那段时间，约瑟夫直在思考自己未来和人生。圣主和所谓神灵在他心目中早已失去价值，他再也不会主动亲吻神圣米字架，听见圣主之名也不会主动下跪祈祷。但这并不妨碍约瑟夫继续以教士身份隐藏在教廷内部。他对教廷内部制度非常熟悉，直接把目光瞄准研究部。那是专属于教廷“科学部门”，尤其是那些颇具身份教士研究员，他们深居简出，身边几乎没有朋友。
约瑟夫选择其中个叫做鲍勃家伙，将其暗杀，成功取代。
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