吴稚晖尤为卖力，不断在《新世纪》上刊登批判章太炎文章。或许是意识到吴稚晖与章太炎之间矛盾很深，孙中山就给吴稚晖写信，声称“陶（陶成章）乃以同盟会为中国，而章（章太炎）则以民报社为中国，以《民报》之编辑为彼
人万世系之帝统”，暗示吴稚晖应加大批判章太炎力度。
这场愈演愈烈内讧，造成g,m阵营巨大内耗。许多g,m党人方面被迫选择站队，另方面也开始重新思考g,m策略与行动方案。1910年，光复会在东京成立总部，章太炎任正会长，陶成章任副会长。不久之后，章太炎与陶成章等人创办《教育今语杂志》，希望用讨论学术形式宣传g,m理念。章太炎弟子钱玄同为该刊撰写发刊词，章太炎本人也用白话文在该刊发表多篇文章，比较系统地论述
对于教育与学术看法。与此同时，全程目睹章太炎与孙中山之间纠纷宋教仁、谭人凤等人，对孙中山总是热衷于在边境地区策划起义做法表示异议，开始筹划在长江流域组织力量进行活动。据日本特务记录，宋教仁在当时曾认为孙中山“已是落后于时代人物，不足以指导g,m趋势”。1911年7月，宋教仁、谭人凤等人在上海成立酝酿已久同盟会中部总会，这对武昌起义爆发起到不小推动作用。章太炎后来也直言：“始，同盟会兴，从事者贸贸然未有所适，或据岭海偏隅以相震耀，卒无所就其谋。自长江中流起者，则渔父（宋教仁）与谭石屏策为多。”
如何评价这场内讧？不可否认，章太炎虽然学识丰富、思想活跃，但却长于思而短于行，不善于在错综复杂g,m形势下做出理智而冷静判断。就连陶成章也觉得“章君太炎，其人并非无才之人，不过仅能画策，不能实行”。因此，当他觉得孙中山有冷落《民报》倾向后，就立即还以颜色，显示自己坚持原则不妥协。而对于刘师培，则又中“君子可欺以方”陷阱。说到底，擅长治学人不定擅长治世，有g,m思想人不定擅长从事g,m工作。
再看孙中山。他对于g,m贡献自然不待多言。可是作为领导者，他似乎比较缺乏团结同志、包容不同意见风范。宋教仁在1907年2月日记里记载：
七时至民报社与黄庆午（黄兴）言余辞职事，庆午不应。良久，庆午忽言，欲退会，断绝关系，其原因则以□□□以己意制新国旗，而庆午以为不善，请其改之。逸仙（孙中山）固执不改，并出不逊之言，故庆午怒而退会。时诸人均在，皆劝之。余则细思庆午不快之原因，其远者当另有种不可推测之恶感情渐积于心，以致借是而发，实则此犹小问题。盖□□（按：此为“逸仙”）素日不能开诚布公、虚心坦怀以待人，做事近于专制跋扈，有令人难堪处故也。今既如是，则两者感情万难调和，且无益耳，遂不劝止之。
黄兴在g,m党内素以忠厚宽
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