此役，浙闽叛军被迫放弃浙南沿海诸县，淮东军收复乐清、瓯海、永嘉、平阳、横阳、温岭、回浦六县，打通陆路与北面明州府宁海县相接
通道。
近三个月来，在浙南前后十数战，共歼俘敌军
万六千余人，其中八闽战卒将近万人；收编乡兵民勇五千余人；缴获兵甲万七千余套。楠溪源河谷役，对淮东军来说，只是给浙南战事个完美尾声。
浙南战事，虽说淮东军也承受近万人伤亡，但由于收编乡兵民勇，又不断从地方征募兵勇，在浙南战事结束之时，先后进入浙南参加诸部，兵力非但未受损失，新编浙南军兵力甚至从战前九千余人增加到万两千余人。
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五月上旬，浙南由旱转雨，雨天频繁，山路艰险难行，诸部也陆续撤回永嘉，放弃对楠溪源河谷搜索。
际杀伤敌兵数量也有限。河谷、山林里到处都是溃兵，这边离仙居近，不能支撑到后面追兵赶上来，让大量溃兵逃回仙居，都不能算大胜。
张季恒终究是人少，突袭时兵力又分散掉
，北撤永嘉守军又是以八闽精锐居多，老卒经验丰富，雨势歇，聚拢三五十人就能打反击。张季恒也只是尽可能将更多人聚集起来，守住河谷中心位置。
好在很快南面有小股溃兵逃过来，这表明刘振之率部将浙闽军殿后兵力杀溃。
很快，刘振之先率五六百精锐赶上来支援，与张季恒汇合，起再往北突击，将几股好不容易聚集起来小股浙闽军打溃，占据河谷北口，将绝大多数溃兵都兜在南面，不使其北逃，也防备仙居守军赶过来接援。
仙居援军姗姗来迟，淮东军后续兵马都已经开拔过来，牢牢占据楠溪源要地，将从仙居过来浙闽军击退。不过对楠溪源河谷周边山林搜索，直持续到五月上旬才结束。
“这回竟然又让秦子檀逃出生天，这狗屎运，真是没有天理啊！”林缚从促俘及击毙敌将名单里
楠溪源河谷役，从永嘉北逃仙居浙闽军几近全军覆灭。永嘉主将温庭瑞及随扈藏身北雁荡山处山坳里，给搜山兵马发现，反抗而给格杀。
搜山兵马初时并不清楚杀条大鱼，温庭瑞当时也换上普通衣甲，只是反抗格外激烈，使得搜山兵马损失十多人，才将他们歼灭，这才引起在楠溪源河谷主持搜山刘振之警觉。只是温庭瑞尸首给泄愤搜索兵马戳得稀烂，还是将面目近乎全非头颅送到永嘉城，才辨认出来。
楠溪源河谷役，俘敌千余人，杀千人，约有千四五百人在混乱跌入水势大涨楠溪江淹死，仅三四百人穿山过林，逃入仙居。
此时，台州守军全面西撤进入临海、仙居坚守，在横阳、平明浙闽军也全面收缩到不易受海路攻击苍南县境内。
陈渍率部接收温岭、回浦等县，耿泉山率部接收横阳、平阳。从二月中旬发动浙南战事在持续近三个月之后，暂告个段落。
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